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基因疗法新拼图:算法揭示 188 种新型 CRISPR 系统

2023/11/25 14:10:47 来源:IT之家 作者:故渊 责编:故渊

IT之家 11 月 25 日消息,科学家近日开发出新算法,在数十亿个蛋白质序列中,成功发现 188 个罕见且以前未知的 CRISPR 连接基因模块,为利用 CRISPR 系统和了解微生物蛋白质的功能多样性提供了新见解。

图源:Carlos Clarivan / Science Photo Library

该项目由 CRISPR 技术先驱张锋教授带领,团队成员来自麻省理工学院麦戈文脑研究所、麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所以及美国国立卫生研究院国家生物技术信息中心(NCBI)等,相关成果于 11 月 23 日发表在《Science》期刊上。

团队开发出新的搜索算法--基于快速局部敏感哈希聚类算法(FLSHclust),使用该算法深入挖掘三个主要的公共数据库,从中识别出了 188 种新型 CRISPR 系统,并对其中 4 个系统进行了详细表征。

这些新系统可能被用来编辑哺乳动物细胞,其脱靶效应比目前的 CRISPR-Cas9 系统要少,也有可能在被用于诊断或用来记录细胞内部活动。

该研究发现了几种已知 I 型 CRISPR 系统的新变体,未来能被用于开发更精准的基因编辑技术。

此外,研究人员还发现了一些 IV 型 CRISPR 系统的新的作用机制,以及精确靶向 RNA 的 VII 型系统(有可能被用于 RNA 编辑)。研究人员表示,该研究突出了 CRISPR 系统前所未有的多样性和灵活性。

IT之家附上论文参考地址:Han Altae-Tran et al.,Uncovering the functional diversity of rare CRISPR-Cas systems with deep terascale clustering.Science382,eadi1910(2023).DOI:10.1126/science.adi1910

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关键词:基因CRISPR科学

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